Nacido el 13 de abril de 1930, su estreno como jugador del CD Tenerife se produjo en octubre de 1948, en un amistoso con el Price, donde coincidió en la delantera con su hermano Sixto, a las órdenes de Andrés Llombet. A partir de entonces, actuó con regularidad en el primer equipo, durante esa temporada, tanto en el campeonato Insular como en la Copa de la Ciudad, igual que en los partidos de la fase preliminar del campeonato Regional.

Sin embargo, Juan Santacruz no tuvo la misma suerte en la siguiente campaña. Participó en el primer tramo de la temporada, durante el campeonato local, pero fue relegado en la fase decisiva, cuando el CD Tenerife afrontó su primer intento por ascender  a categoría nacional, en 1950. Tuvo como rivales a Las Palmas, Imperial, Toledo, Melilla y Ceuta y resultó baldío. 

Debido a este fallecimiento, los jugadores del CD Tenerife lucirán luto en el encuentro de este viernes en Alcalá de Henares.